中书台主管朝廷政务签发，帮助皇帝票拟奏章等，最高长官名称为为中书令（正一品），并设立左右中书仆射两名副手（正二品）。

御史台主管朝廷各级军政官员监察，统领朝廷各级中央到地方的军政御史（各级御史无论品级大小，皆有直接向皇帝参劾之权），最高长官名称为御史中丞（正一品），并设立御史左右丞两名副职（正二品）。

枢密台主管军事，负责全国所有的军事规划、战略制定、战场作战指挥等职能。

枢密台下设，参谋院（战略方针规划）、知军院（战场指挥官任免、情报调查等）、作战院（战场指挥）

最高长官名称为枢密使（正一品），副职两名，枢密都知使（正二品）、枢密同知使（正二品），枢密参使数名（正三品）。

废除尚书省，原尚书省之权分于六部，六部直接向皇帝负责，各部最高长官名称为尚书（从一品），各部皆分设左右侍郎各一人，为正二品。

礼部有原先教育部所改，下设六司：礼仪司、科举司、祭祀司、膳事司、学务司、外务司。

吏部下设四司：文选清吏司、验封司、勋务司、考功司。

兵部下设五司：武将选授司、军种兵籍司、兵备器械司、动员调度司、征兵训练司。（兵部无实际统兵权）

户部下设六司：户籍司、财务司、商贸司、土地司，税赋司、俸饷司。

刑部下设三司：律法司、都察司、理察司。

工部下设四司：工程司、制造司、工匠司、水利司。

各部尚书侍郎以下，各司长官称为郎中（正三品），郎中以下设长令、主令、事令、务令等官职。

除三台六部以外，另设国子监、大理寺、宗人府、太学院等特殊机构，最高长官皆是正二品。

再设内务监、锦衣卫、大魏皇家贸易公司等皇家机构。

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皇家造纸工坊是由王氏造纸工坊改名而来。